Сергей Иванович Филиппов родился 15 ноября 1964 года в селе Белый Колодезь, Вейделевского района, Белгородской области.
С 1988 по 1996 год проходил службу в должностях от командира парашютно-десантного взвода 104 гвардейского парашютно-десантного полка 76 гвардейской воздушно-десантной дивизии города Пскова до командира парашютно-десантного батальона 104 гвардейского парашютно-десантного полка 76 гвардейской воздушно-десантной дивизии города Псков.
С июля по декабрь 1992 года выполнял задачи в составе Смешанных сил по установлению мира и поддержанию правопорядка в зоне Грузино – Осетинского конфликта.
С ноября 1994 года по июль 1995 года в составе Федеральных войск принимал участие в боевых действиях на территории Чеченской республики.
С 1999 по 2005 год проходил службу в должностях от начальника отдела по делам гражданской обороны и чрезвычайным ситуациям – заместитель начальника гражданской обороны района «Южное Медведково» Северо – Восточного административного округа г. Москвы до начальника Центра управления в кризисных ситуациях Главного управления МЧС России по городу Москве.
Указом Президента Российской Федерации от 4 июля 2014 года № 487 назначен начальником Главного управления МЧС России по Рязанской области.
В 1988 году окончил Рязанское военное воздушно-десантное училище имени Ленинского комсомола; В 1999 году окончил Военную академию имени М.В.Фрунзе; В 2004 году окончил Московский государственный социальный университет Министерства труда и социального развития Российской Федерации.