Работает в РГУ имени С.А. Есенина с 2007 г. в должности старшего научного сотрудника научной лаборатории эволюционной экологии, с 2009 г. руководителя научной лаборатории эволюционной экологии.
В 2008 г. И.В. Зацаринный досрочно защитил диссертацию на соискание ученой степени кандидата биологических наук на тему: «Сравнительная экология гаичек (Parus, Poecile) Восточной Европы» по специальности 03.00.16 – экология. В настоящее время он продолжает научные исследования, которые направлены на поиск решения фундаментальных проблем биологии и экологии животных, и связаны с установлением наиболее важных параметров структуры экологической ниши птиц, комплексного описания характера экологической ниши и роли каждого конкретного вида в экосистеме, механизмов формирования сообществ у птиц.
Участвует в научных исследованиях, направленных на изучение естественных и нарушенных экосистем, и внедрении их результатов в практику природопользования. Осуществляет научные исследования на территории Рязанской, Мурманской, Витебской областей, в республике Карелия. Принимает участие в научно-исследовательских работах, направленных на обоснование мер по охране и рациональному использованию объектов животного мира на территории Рязанской области, экологической оценке природной среды в районе действия ОАО «Кольская ГМК» в Мурманской области. В составе коллектива российских ученых, принимал участие в разработке научной части проекта создания первого в России трехстороннего (международного) национального парка в регионе Инари-Пасвик, включающего особо охраняемые природные территории Финляндии, Норвегии и России. Осуществляет координацию научного сотрудничества РГУ имени С.А. Есенина и совместных научных исследований в области изучения экологии животных с заповедниками и национальными парками РФ и республики Беларусь (НП «Мещерский», Окский государственный природный биосферный заповедник, Березинский биосферный заповедник, заповедник «Пасвик»).
Зацаринный И.В. имеет 38 научных работ, из них 4 монографии (в соавторстве) и 1 учебное пособие (в соавторстве).
Имеет государственные награды.
В 2008 – 2010 гг. руководил Рязанским областным советом молодых ученых, с октября 2010 г. возглавляет СНО РГУ имени С.А. Есенина.